大変お待たせしました。

> カテゴリページ更新くんの使い方はいまいちわかっておらず一括で置換をしたいのですが
> 置換ボタンを押したら特に禁止タグは使っていないのに項目が赤くなりRMSに更新ボタンを押しても
> 変更されておらずもう一度１から置換をやり直し、更新ボタンを押す前に項目をダブルクリックで編集、
> 変更後保存とやったら項目が赤いのも消え変更されていました。

こちらにつきましては
楽天市場の禁止タグチェックの仕様が変わったことにより
カテゴリーページ更新君プラス(R)(API)版での
禁止タグチェック機能が予期せぬ不具合が発生しておりました。

> 一括で置換をする場合１個づつ変更後保存ボタンを押さなければいけませんか？
> また置換後項目が赤くなり禁止タグ削除をすると変更前の文字列に戻ってしまいます。
> なにかやり方が間違っているのでしょうか？

頂いた操作動画も確認させていただきましたが
操作手順につきましてはわくわくさんの手順で問題ございません。

上記で記載させていただきましたが、
原因としては、楽天の仕様変更によるツールの異常となります。

つきましては、事務局にて不具合が起きないように
最新バージョンをご用意させていただきましたので

以下URLからインストールしていただき
わくわくさんの方でも動作確認をお手数ですが
よろしくお願いします。

https://club.ec-masters.net/ecm/tool/categorypagekoshinkun-plus_220222.zip