ECマスターズの鈴木です。

> Rたすく3（2のChrome版）の実質的な対応商品数はどのくらいでしょうか。
> 先日R-たすくを１年分購入してみたのですが、動きが相乗以上に重たく、
> これでは日常業務で使えないなと感じております。
> 当店の商品数は4200件で、販売中のものは2600件、在庫アリのページで1000件ほどあります。

実質的な対応商品数はございませんが、
こちらは楽天の商品一括編集機能とデータ更新時の仕様が異なる点として、
1商品1-3秒で更新を行いますので、商品数が多ければ多い程、
更新時間が少し遅くなる傾向がどうしてもございます。

> 在庫があるページだけの商品情報ダウンロードなどができれば、
> 実用的に使えるのかとも考えておりますが、
> 何かよい方法ございましたらご共有いただけますと幸いです。

下記のキャプチャをご参照いただき、

https://ec-masters.gyazo.com/5f7024faec6fb0f4eebd8ba155472e98

画面左上より変更したい在庫数が1以上の商品のみを表示するように
条件を設定した後、条件一致商品表示を押下いただくことで、
在庫が登録されている商品のみを表示することができますので、
お試しになってみてください。