ECマスターズの鈴木です。

> 先日からYahooショッピングでコンビニ前払いを使えるようにしたのですが、
> 支払期日は店舗側で決めても良いのでしょうか？

支払い期限に関しては、店舗側で決定をして問題ありません。

1点注意点として、下記のガイドラインにございますように、

コンビニ決済の各種ステータス
https://store-info.yahoo.co.jp/s/shopping/toolmanual/orderdata/g/153.html

支払い番号の有効期限は、発行日の翌日から10日となりますので、
最長の10日間より短い期日で表記していただくようお願いいたします。

> また、楽天のように1週間なら1週間で自動的にキャンセルになりますか？

ヤフーにも確認をしたところ、自動でキャンセルされる機能はございませんので、
こちらは店舗側にて手動でキャンセル処理を
行なっていただく必要がございます。